Analyse d'expression différentielle par séquençage rationalisé : technologie 3'RNA-seq

Yannick Lippi et Gaëlle Payros de la plateforme TRIX de Toxalim nous présentent la technologie QuantSeq 3’ RNAseq

La technologie QuantSeq : transcriptomique accessible

La technologie QuantSeq 3’ RNAseq représente une avancée majeure dans le domaine du séquençage de l’ARN, en proposant une méthode rapide, précise et économique pour le profilage de l’expression génique. Contrairement aux approches traditionnelles qui séquencent l’ensemble du transcriptome, QuantSeq se concentre uniquement sur l’extrémité 3’ des ARN messagers polyadénylés. Cette stratégie permet de générer un seul fragment par transcrit, simplifiant considérablement l’analyse bioinformatique et réduisant les biais liés à la profondeur de séquençage. On vous exposera les résultats obtenus sur des échantillons tissulaires et sanguins.