Expertises

Les activités du plateau reposent sur différentes compétences de biologie moléculaire et de bio-informatique, pour fournir un service clé en main de l'échantillon d'ARN jusqu'au rapport d'analyse.

Services

Analyse globale du transcriptome sans a priori :

• Puces d’expression génique par Microarray
• Préparation des librairies pour :
  • Séquençage orienté des ARN polyadénylés : mRNAseq
  • Séquençage orienté rationalisé des ARN polyadénylés : 3’ mRNA-Seq
  • Séquençage orienté des ARN non polyadénylés (ribo-déplétion) : Total RNAseq
  • Séquençage des petits ARN non codants : miRNA, siRNA … : SmallRNAseq

Analyse d'expression transcriptionnelle ciblée :

• Automate de pipetage et distribution avec une quarantaine de programmes définis en plaques 384 puits
• Design à façon de programmes de distribution
• Système de PCR (Polymerase Chain Réaction) en temps réel QuantStudio 5 et logiciel d'analyse

Contrôle qualité des échantillons :

• Qualité des acides nucléiques TapeStation 4200
• Concentration des acides nucléiques par spectrophotomètre DropSense 96 ou Nanodrop

Mise à disposition d'équipement et d'outils :

• Formation à l’utilisation :
  • Automate de distribution pour préparation des plaques en 384 puits
  • Système de PCR (Polymerase Chain Réaction) en temps réel QuantStudio 5
  • TapeStation 4200
  • DropSense 96
  • Nanodrop
• Application web MATRIX pour explorer les résultats d’analyses transcriptomiques https://matrix.toulouse.inrae.fr

Recherche et Développement

• Automatisation des protocoles et des purifications
• Miniaturisation de la préparation de librairies RNAseq
• Protocoles personnalisables en fonction de besoins spécifiques

Fonctionnement : 3 façons de travailler avec nous

Contactez-nous